《X档案第二季》于1994年在美国首播，延续了第一季的悬疑科幻风格。本季中，FBI探员福克斯ⷀ穆德与达娜ⷀ斯科莉继续调查一系列超自然现象与政府掩盖的神秘事件。穆德坚信外星生命的存在，并执着追寻妹妹幼年失踪的真相；而崇尚科学的斯科莉则试图为这些案件寻找理性解释，两人在合作中不断磨合，关系也愈发紧密。
本季剧情深入拓展了主线阴谋“X档案”的复杂网络，引入了“吸烟人”等关键反派，揭示了外星殖民计划与人类政府勾结的黑暗内幕。同时，单元剧集涵盖了变异怪物、灵异现象、古老诅咒等多类奇异案件，如《恐惧症》中的基因实验怪物、《电锯狂人》中的都市传说等，在探索未知的同时也深刻反思了人性、科学与信仰的边界。第二季在巩固系列核心主题的基础上，进一步提升了叙事张力与世界观深度，成为推动整个系列走向经典的关键一季。
